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刘振  
进化遗传学与基因组学学科组
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  简  历

博士,特聘青年研究员,中国科学院“青年创新促进会”会员。主要以非模式动物为研究对象,结合比较基因组学、进化遗传学和功能基因组学的理论和方法,探索适应性复杂性状起源和演化的分子遗传机制,从分子演化的角度探讨基因型和表型的相互作用关系。长期目标是将非模式动物的适应性表型与人类健康疾病相联系,通过分子适应性进化的理论对非模式动物适应性复杂性状的分子遗传基础进行解析,为理解人类健康与疾病的分子机制提供新思路和研究策略。

学习和工作经历:

2018.09 - 至今:中国科学院昆明动物研究所,遗传资源与进化国家重点实验室,研究员

2013.01 – 2018.09:中国科学院昆明动物研究所,遗传资源与进化国家重点实验室,副研究员

2016.12 – 2017.12:密歇根大学,生态与进化生物学系,访问学者

2007.09 – 2013.01:中国科学院大学,获遗传学博士学位

2002.09 – 2006.06:烟台大学,生命科学学院,获理学学士学位

  研究方向

1)探讨非模式动物适应性表型的分子演化和遗传机制。

由于所处生态环境的不同,各种动物在长期演化过程中起源和发展出了不同的适应性复杂表型,从而更好地适应了各自所面临的自然选择压力。但是,这些适应性表型起源和演化的分子机制并不清楚,具体表现在:(i)自然选择和随机因素在分子水平上如何相互作用导致了适应性表型的起源和演化?(ii)表型水平的适应性与分子水平的适应性具有多大程度的一致性?(iii)分子变异的重复性和预测性与适应性的相互关系如何?非模式动物的基因组数据的大量积累为我们研究这些问题提供了丰富的材料,通过整合群体遗传学、分子演化、比较基因组学、进化遗传学等多种分析手段,全面揭示非模式动物适应性表型与基因型间的关系。

2)揭示非模式动物适应性复杂表型与人类健康疾病的关系,通过对适应性复杂表型分子遗传机制的阐明,为理解人类健康疾病的分子机理提供新的视角。

非模式动物具有多种多样的复杂表型,其中有些表型与人类健康疾病密切相关。例如,蝙蝠的寿命显著高于相同体型的其它哺乳动物;蝙蝠具有更有效的免疫系统,因而能携带大量病毒而不患病;食果蝙蝠代谢血糖的速率要显著快于其它哺乳动物等。我们拟利用进化遗传学、功能基因组学等多种分析方法,阐明这些与人类健康疾病密切相关的适应性表型的分子演化与遗传机制。

  承担科研项目

主持的科研项目

1、国家自然科学基金青年科学基金项目,31301013,听力基因prestin在回声定位哺乳动物中的功能研究,2014/01-2016/12

2、国家自然科学基金面上项目,31871270,回声定位蝙蝠转录组的趋同演化与基因表达调控网络的解析,2019/01-2022/12

3.中国科学院“西部之光”项目。
  专家类别
研究员
  社会任职
  获奖及荣誉

2012年,中国科学院“院长优秀奖学金”;

2013年,入选中国科学院“青年创新促进会”;

2014年,云南省优秀博士学位论文奖。

  代表论著

1.        Liu Z, Qi FY, Xu DM, Zhou X and Shi P. (2018) Genomic and functional evidence reveals molecular insights into the origin of echolocation in whales. Science Advances. 4:eaat8821. (Impact factor in 2018: 11.5)

2.        Liu Z, and Zhang J (2018) Human C-to-U coding RNA editing is largely nonadaptive. Molecular Biology and Evolution. 35:963-969. (5-Year impact factor in 2016: 14.6)

3.        Liu Z, and Zhang J* (2017) Most m6A RNA modifications in protein-coding regions are evolutionarily unconserved and likely nonfunctional. Molecular Biology and Evolution. 35:666-675. (5-Year impact factor in 2016: 14.6)

4.        Li YY#, Liu Z#*, Qi FY, Zhou X, Shi P* (2016) Functional effects of a retained ancestral polymorphism in prestin. Molecular Biology and Evolution 34:88-92. (#co-first author; *Corresponding author; 5-Year impact factor in 2016: 14.6)

5.        Zhang Z, Wu Q, Zhang G, Zhu Y, Murphy R, Liu Z*, Zou C* (2015) Systematic analyses reveal uniqueness and origin of the CFEM domain in fungi. Scientific. Reports 5:13032. (*Corresponding author; 5-Year impact factor in 2015: 5.5)

6.        Liu Z, Qi FY, Zhou X, Ren HQ and Shi P* (2014) Parallel sites implicate functional convergence of the hearing gene prestin among echolocating mammals. Molecular Biology and Evolution 31:2415-2424. (5-Year impact factor in 2014: 11.7)

7.        Liu Z* (2014) Codon 104 of p53 is not an adaptively selected site for extreme environments in mammals of the Tibet plateau. PNAS 111:E2357. (5-Year impact factor in 2014: 10.6)

8.        Liu Z, Wang W, Zhang TZ, Li GH, He K, Huang JF, Jiang XL, Murphy RW, and Shi P* (2013) Repeated functional convergent effects of NaV1.7 on acid insensitivity in hibernating mammals. Proceedings of the Royal Society B Biological Sciences 281:20132950. (5-Year impact factor in 2013: 5.8)

9.        Liu Z, Li GH, Huang JF, Murphy RW, and Shi P* (2012) Hearing aid for vertebrates via multiple episodic adaptive events on prestin genes. Molecular Biology and Evolution 29:2187-2198. (5-Year impact factor in 2012: 11.2)

10.    Liu Z, Li S, Wang W, Xu DM, Murphy RW, and Shi P* (2011) Parallel evolution of KCNQ4 in echolocating bats. PLoS One 6:e26618. (5-Year impact factor in 2011: 4.5)

11.    Li Y#, Liu Z#, Shi P, and Zhang J* (2010) The hearing gene Prestin unites echolocating bats and whales. Current Biology 20:R55-56. (#co-first author; 5-Year impact factor in 2010: 11.4)

  研究团队

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