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高云正高级工程师

西南家猪分子育种与转化医学研究基地; “遗传资源与进化”国家重点实验室分子进化与基因组多样性学科组

职　　务：

西南家猪分子育种与转化医学研究基地主任

学　　历：

博士研究生

电　　话：

0871-68526519

传　　真：

电子邮件：

gaoy@mail.kiz.ac.cn

通讯地址：

中国科学院昆明动物研究所，昆明市茨坝镇青松路21号 650203

其他主页：

简　　历

高云，女，1973年4月出生，农学博士，正高级工程师，中国科学院关键技术人才，云南省中青年学术技术带头人。现任西南家猪分子育种与转化医学研究基地主任、云南省畜禽分子生物学重点实验室副主任。

2001年毕业于中国农业大学动物医学院预防兽医学专业，获农学博士学位；2001-2004年在北京师范大学生命科学院生物化学与分子生物学系任讲师，获2005年度国家级教学成果奖二等奖（分子生物学及生物技术实验教学创新体系的建立与实践，第四完成人）；2003-2004年在加拿大Queen’s University微生物与免疫学系进行博士后研究，开展沙门氏菌功能基因组研究。2005年至今在中科院昆明动物研究所“遗传资源与进化”国家重点实验室工作，现兼任中国科学院昆明动物研究所第二届生物安全委员会委员和国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心学术指导委员会专家组成员。2021年入选中国科学院关键技术人才。

主要从事家猪分子育种及猪模型转化医学应用方向的技术攻关与育种基地管理与成果产业转化工作，围绕野生和家养动物在自然选择及人工选择作用下的进化模式和基因组进化规律的科学问题，开展猪经济性状基因的规模化发掘、功能验证与育种价值评价、育种材料和重大疾病猪模型的创制与标准化繁育技术攻关及其在新型药物、疫苗、医疗器械临床前评估评价中的应用和产业化开发工作。作为负责人承担国家转基因新品种培育重大专项2项和“分子模块设计育种创新体系”A类先导专项课题2项。在Journal of Biogeography, Heredity, PNAS，Nature Communications, Genome Biology and Evolution, PLos ONE, Scientific Reports等SCI刊物上发表研究论文13篇，其中第一作者1篇、共同第一作者/共同通讯作者2篇，参与发表10篇。联合培养博士毕业生1名和硕士毕业生2名。

研究方向

研发多维度、高通量、自动化、智能化表型组学采集和测定技术以及多类型海量数据整合分析技术，建立智能化高通量表型数据采集系统，开发不同表型组数据分析理论及高效计算方法，解析表型-基因型-环境的互作机制。

依托西南家猪分子育种与转化医学研究基地开展畜禽和重大疾病动物医学模型全生命周期多维度（从胚胎发育到出生、成长、衰老乃至死亡过程中，从宏观到微观（即分子组成）、形态特征、功能、行为、分子组成规律等生物、物理和化学特征）的表型组学研究，确定其标准研究时序队列，基于时序队列构建标准化参考数据集（库）；研发不同表型组数据分析理论及高效计算方法，系统解构表型之间跨尺度关联，准确评估生猪育种新材料的育种价值与育种效率以及医学动物模型及相关干预治疗手段的有效性，为我国生物种业创新和生物医药生命大健康产业发展保驾护航。

承担科研项目

1. 中国科学院A类先导专项"种子精准设计与创造"子课题，猪育种示范基地建设与完善，2019.11-2024.12，326万元，在研，主持

2. 中国科学院A类先导专项“分子模块设计育种创新体系”子课题，西南分子育种基地的完善与能力提升，2013.8-2017.12，1267 万元，已结题，主持

3. 中国科学院技术支撑人才项目“西南家猪分子育种与转化医学应用平台及技术支撑能力建设”，2022.1-2025.12，40万元，在研，主持

4. 科技部重点研发项目任务“耳聋伴耳鸣临床干预新技术研发及网络化平台建设”，2019.1-2022.12，40万元，在研，项目骨干

5. 昆明市春城计划“动物模型与转化医学应用”创新创业团队项目，2022.1-2026.12，3000万元，在研，项目骨干

6. 中国科学院科研平台建设项目，西南家猪分子育种基地智能化系统，2016.1-2017.12，460万元，主持

7. 农业部转基因生物新品种培育重大专项子课题“猪、牛、羊肌肉生长和脂肪沉积性状重要育种价值基因的克隆及其功能验证”，2016.1-2020.12，已结题，主持

8. 农业部转基因生物新品种培育重大专项子课题“动物重要基因克隆与功能验证-基于人工选择作用分析克隆鉴定重要功能基因”， 2011/07-2015/12，655 万元，已结题，主持

专家类别

中国科学院关键技术人才，云南省中青年学术与技术带头人后备人才

社会任职

中国科学院昆明动物研究所第二届生物安全委员会委员

国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心学术指导委员会专家组成员

获奖及荣誉

2005 国家级教学成果奖二等奖（分子生物学及生物技术实验教学创新体系的建立与实践；第一单位，第四完成人）

代表论著

1. Gao Y^#, Wang SY^#, Luo J, Murphy RW, Du R, Wu SF, Zhu CL, Li Y, Poyarkov AD, Nguyen SN, Luan PT, and Zhang YP*. Quaternary palaeoenvironmental oscillations drove the evolution of the Eurasian Carassius auratus complex (Cypriniformes, Cyprinidae). Journal of Biogeography 2012, 39:2264-2278.

2. Wang SY, Luo J, Murphy RW, Wu SF, Zhu CL, Gao Y*, and Zhang YP*. Origin of Chinese Goldfish and Sequential Loss of Genetic Diversity Accompanies New Breeds. PLos One 2013, 8. （共同通讯作者）

3. Luo J^#, Gao Y^#, Ma W, Bi XY, Wang SY, Wang J, Wang YQ, Chai J, Du R, Wu SF, Meyer A, Zan RG, Xiao H, Murphy RW, and Zhang YP. Tempo and mode of recurrent polyploidization in the Carassiusauratus species complex (Cypriniformes, Cyprinidae). Heredity 2014,112:415-427.（共同第一作者）

4. Wang GD, Zhai WW, Yang HC, Fan RX, Cao X, Zhong L, Wang L, Liu F, Wu H, Cheng LG, Poyarkov AD, Poyarkov NA, Tang SS, Zhao WM, Gao Y, Lv XM, Irwin DM, Savolainen P, Wu CI, and Zhang YP*. The genomics of selection in dogs and the parallel evolution between dogs and humans. Nature Communications 2013, 4.

5. Wang GD, Fan RX, Zhai WW, Liu F, Wang L, Zhong L, Wu H, Yang HC, Wu SF, Zhu CL, Li Y, Gao Y, Ge RL, Wu CI, and Zhang YP*. Genetic Convergence in the Adaptation of Dogs and Humans to the High-Altitude Environment of the Tibetan Plateau. Genome Biology and Evolution 2014, 6: 2122-2128.

6. Lu MD, Han XM, Ma YF, Irwin DM, Gao Y, Deng JK, Adeola AC, Xie HB*, Zhang YP*. Genetic variations associated with six-white-point coat pigmentation in Diannan small-ear pigs. Scientific Reports, 2016, 6.

7. Liu SJ, Luo J, Chai J, Ren L, Zhou Y, Huang F, Liu XC, Chen YB, Zhang C, Tao M, Lu B, Zhou W, Lin GL, Mai C, Yuan S, Wang J, Li T, Qin QB, Feng H, Luo KK, Xiao J, Zhong H, Zhao RR, Duan W, Song ZY, Wang YQ, Wang J, Zhong L, Wang L, Ding ZL, Du ZL, Lu XM, Gao Y, Murphy RW, Liu Y, Meyer A, Zhang YP*. Genomic incompatibilities in the diploid and tetraploid offspring of the goldfish x common carp cross. PNAS, 2016, 113:1327-1332.

8. Luo J, Chai J, Wen YL, Tao M, Lin GL, Liu XC, Ren L, Chen ZY, Wu SG, Li SN, Wang YD, Qin QB, Wang S, Gao Y, Huang F, Wang L, Ai C, Wang XB, Li LW, Ye CX, Yang HM, Luo M, Chen J, Hu H, Yuan LJ, Zhong L, Wang J, Xu J, Du ZL, Ma ZS, Murphy RW, Meyer A, Gui JF, Xu P, Ruan J, Chen ZJ, Liu SJ*, Lu XM*, Zhang YP*. From asymmetrical to balanced genomic diversification during rediploidization: Subgenomic evolution in allotetraploid fish. Science Advances, 2020, 6(22)

9. Li JB, Wang LG, Yu DW, Hao JF, Zhang LC, Adeola AC, Mao BY, Gao Y, Wu SF, Zhu CL, Zhang YQ, Ren JL, Mu CG, Irwin DM, Wang LX*,Hai T*, Xie HB*, Zhang YP*.Single-cell RNA-sequencing Reveals Thoracolumbar Vertebra Heterogeneity and Rib-genesis in Pigs. 2021. Genomics Proteomics & Bioinformatics, 19:423-436 IF11.12

研究团队

研发团队：

团队成员及工作人员：

邓家坤工程师

杨虓助理工程师

浦照助理工程师

研究生（专业硕士）：

曹雪娜，2020级

宋修成，2021级

黄爱如，2022级