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谢海兵  副研究员
分子进化与基因组多样性学科组
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  简  历

简历 

谢海兵,男,理学博士,副研究员,中国科学院昆明动物研究所分子进化与比较基因组学研究组。主要以家猪以及野生近缘种为研究对象,从事猪的比较基因组学和转录组学研究。围绕猪重要经济性状(生长发育、抗病、繁殖等)调控基因发掘以及猪种杂交利用开展基因组学研究。先后主持国家自然科学基金,科技部863项目课题研究任务,科技部973项目课题研究任务以及作为项目骨干参加中国科学院战略性先导专项(A)类子课题2项,以第一或通讯作者(含共同)在Molecular Biology and EvolutionGenome Biology and EvolutionJ Genet GenomicsBMC Genomics等国内外重要刊物上发表SCI论文十多篇,授权专利十余项。  

学习和工作经历 

202012-至今,中国科学院昆明动物研究所,副研究员 

20094-202012月,中国科学院昆明动物研究所,助理研究员 

20088-20094月,中国科学院昆明动物研究所,研究实习员 

19989-20027月,四川大学生命科学院生物化学专业,本科 

  研究方向

目前主要利用不同的猪种资源开展猪群比较基因组研究,获取与重要经济性状形成相关的调控基因与分子调控网络,并通过家系研究猪杂交繁育体系中的基因组不兼容性,研究导致杂种不存活的基因组调控机制,主要研究方向包括: 

1)猪高产优质性状的分子调控网络解析 

2)猪种间基因组互作与杂种胚胎存活率的遗传机制解析 

3)家猪驯化与人工选择作用研究 

  承担科研项目

1、东亚家猪早期驯化的基因组适应机制研究,31472000,国家自然科学基金面上项目,2015.01-2018.12, 89万元,主持

2、猪高产优质性状的分子基础,XDA24010107,中科院战略性先导科技专项(A类)子课题,2019.11-2024.12 722万元,参与 

3、猪优质高产分子模块解析,XDA08010304,中科院战略性先导科技专项(A类)子课题,2013.08-2018.72543.51万元,参与 

4、特色基因资源挖掘及培育滇南小耳猪优良肉质种猪新品系,2011AA100304,科技部863计划课题任务,2011.01-2015.12 174万元,主持 

5、猪的人工选择机制与研究,2013CB835203,科技部963计划课题任务,2015.01-2018.08, 60万元,主持
  专家类别
  社会任职
 
  获奖及荣誉
 
  代表论著

1.Xie HB#*(共同第一,共同通讯), Wang LG#, Fan CY#, Zhang LC#, Adeola AC, Yin X, Zeng ZB*, Wang LX*, Zhang YP* 2021. Genetic architecture underlying nascent speciation – The evolution of Eurasian pigs under domestication. Mol Biol Evol. (In press) (1区,5-year IF= 13.401) 

2.Ma YF, Adeola AC, Sun YB, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2020. CaptureProbe: a java tool for designing probes for capture Hi-C applications. Zool Res. 41: 94-96. (1区,2019 IF= 2.638) 

3.Ma YF, Huang CP, Lu FR, Li JX, Han XM, Adeola AC, Gao Y, Deng JK, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2020. OrthReg: a tool to predict cis-regulatory elements based on cross-species orthologous sequence conservation. Zool Res. 41: 471-475. (1区,2019 IF= 2.638) 

4.Ma C, Khederzadeh S, Adeola AC, Han XM, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2020. Whole genome resequencing reveals an association of ABCC4 variants with preaxial polydactyly in pigs. BMC Genomics 21: 268. (2区,5-year IF= 4.093) 

5.Yang Y, Liu C, Adeola AC, Sulaiman X, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2019. Artificial selection drives differential gene expression during pig domestication. J Genet Genomics 46: 97-100. (1区,5-year IF=4.732) 

6.Ma YF, Han XM, Huang CP, Zhong L, Adeola AC, Irwin DM, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2019. Population Genomics Analysis Revealed Origin and High-altitude Adaptation of Tibetan Pigs. Sci Rep 9: 11463. (3, 5-year IF= 4.576) 

7.Khederzadeh S, Kusza S, Huang CP, Markov N, Scandura M, Babaev E, Sprem N, Seryodkin IV, Paule L, Esmailizadeh A, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2019. Maternal genomic variability of the wild boar (Sus scrofa) reveals the uniqueness of East-Caucasian and Central Italian populations. Ecol Evol 9: 9467-9478. (2区,5-year IF= 2.749)  

8.Yang Y, Adeola AC, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2018. Genomic and transcriptomic analyses reveal selection of genes for puberty in Bama Xiang pigs. Zool Res. 39: 424-430. (1区,2018 IF= 1.556) 

9.Lü MD, Han XM, Ma YF, Irwin DM, Gao Y, Deng JK, Adeola AC, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2016. Genetic variations associated with six-white-point coat pigmentation in Diannan small-ear pigs. Sci Rep 6: 27534. (3, 5-year IF= 4.847) 

10.Zhou ZY, Li AM, Wang LG, Irwin DM, Liu YH, Xu D, Han XM, Wang L, Wu SF, Wang LX*, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2015. DNA methylation signatures of long intergenic noncoding RNAs in porcine adipose and muscle tissues. Sci Rep 5: 15435. (3, 5-year IF= 5.525) 

11.Wang GD, Xie HB, Peng MS, Irwin D, Zhang YP 2014. Domestication Genomics: Evidence from Animals. Annu Rev Anim Biosci. 2: 65-84. (1区,2019 IF= 6.091) 

12.Zhou ZY, Li AM, Adeola AC, Liu YH, Irwin DM, Xie HB*(共同通讯), Zhang YP* 2014. Genome-wide identification of long intergenic noncoding RNA genes and their potential association with domestication in pigs. Genome Biol Evol 6: 1387-1392. (2区,5-year IF= 4.529) 

13.Ma YF#, Xie HB#(共同第一), Han XM, Irwin DM, Zhang YP 2013. QcReads: an adapter and quality trimming tool for next-generation sequencing reads. J Genet Genomics 40: 639-642. (1, 5-year IF=2.42) 

  研究团队

 

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