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张亚平  研究员;中国科学院院士;欧洲科学院外籍院士;第三世界科学院院士
分子进化与基因组多样性学科组
职  务: 中国科学院副院长
学  历: 理学博士
电  话: +86 871 68526519
传  真: +86 871 68526519
电子邮件: zhangyp@mail.kiz.ac.cn
通讯地址: 云南省昆明市盘龙区青松路21号    650201
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  简  历

  博士,研究员,中国科学院院士,欧洲科学院外籍院士,发展中国家科学院院士。现任中国科学院副院长、昆明动物研究所“遗传资源与进化”国家重点实验室学术委员会主任和分子进化与基因组多样性学科组负责人;国际重要刊物Genome Biol Evol 副主编、 Hum Mol Genet Zool Res Chinese Sci BullSci Rep等编委。

  建立我国第一个野生动物种质资源库,任我国生命领域首个大科学设施——中国西南野生生物种质资源库动物种质资源库主任。通过推动西南家猪分子育种与转化医学研究基地的建设,为国家生猪种业与大动物医学模型研究与转化应用提供平台支持及源头创新的育种新材料和疾病模型创制。

  利用保藏的资源,主要从分子水平研究生物多样性的演化及机制,澄清了灵长类、食肉类、两栖爬行类等动物类群系统与演化中的一些重要问题。揭示了东亚人群进化的一些规律和一些民族的演化历程。系统地研究了野生动物和家养动物的遗传多样性,发现遗传多样性贫乏与物种濒危之间没有必然的对应关系;确定了家犬的东亚起源,证明东亚是家养动物驯化的重要区域。对自然选择和人工选择作用下基因组进化的研究,揭示了一些重要的动物适应进化和畜禽经济性状形成的遗传机制。在Science、NatureNature GeneticsPNAS等国际刊物发表SCI论文300余篇,专著1部。先后获国家自然科学二等奖、长江学者成就一等奖、云南省科技突出贡献奖、何梁何利基金科学与技术进步奖等国家和省部级科技奖励20余项。由于在生物多样性研究领域的突出贡献,获国际重要奖项“生物多样性领导奖”,成为该奖项亚洲地区首个获奖人。联合发起国际生命条形码计划(iBOL)并使中国成为全球四个节点之一,牵头组织了世界两栖爬行类DNA条形码计划(Cold Code)、家犬基因组研究国际联盟(Dog10K)等大型国际合作,代表中国参加万种脊椎动物基因组计划(Genome 10K),产生了广泛的国际影响。

  Research.com网站评选2022年度遗传与分子生物学领域中国科学家排名第9

  全球学者库评选2022年度生物学科领域中国科学家排名第8

 

教育工作经历 

  1982-1986       复旦大学生物系,学士

  1986-1991       中国科学院昆明动物研究所,博士

  1991-1992       中国科学院昆明动物研究所,助理研究员

  1992-1995       美国圣地亚哥濒危动物繁殖中心(CRES)分子遗传实验室,博士后

  1995-2000       中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室主任,研究员

  1996-2005       中国科学院昆明动物研究所副所长

  2005-2012.4    中国科学院昆明动物研究所所长

  2003-至今        中国科学院院士

                          云南大学特聘教授

  2007.11-至今   发展中国家科学院院士

  2008-2016       遗传资源与进化国家重点实验室主任

  2012.01-至今   中国科学院副院长

  2018-至今        欧洲科学院院士

 

学生培养

  已培养中国科学院昆明动物研究所学籍博士47名,硕士13名,博士后8名。其中2人获全国优秀博士论文,4人获中科院优秀博士论文,2人获中科院院长特别奖。

  

  研究方向

    近年以家养动物为模式系统,重点开展以下研究:

  1、复杂性状遗传的分子基础

  家养动物在早期驯化以及近期快速品种选育过程中,在整体遗传多样性降低的同时表现出丰富的表型多样性,为复杂性状遗传机制研究提供了关键的素材。学科组运用群体基因组学、3D基因组学、单细胞图谱、基因编辑、人工智能等新兴技术,围绕家养动物的重要经济性状和高级社交行为,系统深入解析复杂性状遗传的分子基础。相关研究工作及其成果将服务于种业创新和大动物疾病模型创建与转化医学应用。

  2、遗传育种与新品种创制

  紧紧围绕国家“种业创新”重大战略需求,针对猪、鸡等重要家养动物开展遗传育种研究,发掘重要经济性状的调控新基因;基于家养动物品种资源基因组互作网络研究杂交繁育体系对表型性状形成的影响;运用多组学技术与方法解析性状形成的分子调控网络;运用基因编辑和核心群精准设计等手段开展分子模块育种新材料构建与新品种创制。

  3、人社交障碍疾病的动物模型创建与应用

  家犬作为最早被人类驯养的家养动物,与人类共享潜在精神疾病及致病基因,具有与人的跨物种社会情感交流。研究组聚焦于自闭症、强迫症、抑郁症等社交障碍类人类重大精神疾病疾病,以家犬为主要动物模型,探究影响社交障碍疾病行为的遗传基础及神经生物学机制,为疾病诊断、药物开发、医疗器械和干预治疗开发提供有力支撑。

  承担科研项目

近年部分项目

1.   科技部2030脑计划重大项目 “社交障碍的神经环路机制与干预研究” 2021.12-2026.11

2.   中科院A类先导科技专项 “猪高产优质性状的分子基础” 2019.11-2024.10

3.   云南省重点研发计划 “分子检测和基因编辑技术的研发与应用” 2022.01-2024.12

4.   战略性先导科技专项 “猪脂肪沉积等优质高产分子模块解析”2013.08-2018.12

5.   国家自然科学基金重大项目动物DNA 条形码基因和隐存多样性的研究”2011.01-2014.12

6.   国家重点基础研究发展计划中国-喜马拉雅地区生物多样性演变和保护研究” 2007.07-2011.08

7.   国家杰出青年科学基金 “分子进化中若干重要问题的研究” 1996.01-1998.12

  专家类别
中国科学院院士,欧洲科学院外籍院士,发展中国家科学院院士,国家杰出青年科学基金获得者,(新世纪)百千万人才工程国家级人选, 享受国务院政府特殊津贴专家,省、部级有突出贡献专家”
  社会任职

2009-至今《Genome Biology and Evolution》副主编

2013-至今《Human Molecular Genetics》编委

2013-至今《Scientific Reports》编委

Zoological Research 》、 《 Chinese Science Bulletin 》、《Biodiversity Science》、 《中国科学》、《整合动物学》、《动物学报》编委

  获奖及荣誉

国际奖

2002 美国“The Bay Foundation and the Josephine Bay and C. Michael Paul Foundation”的“生物多样性领导奖”(Biodiversity Leadership Awards

 

国内奖

国家奖

2006 国家自然科学二等奖(线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究)

2014 国家自然科学奖二等奖(基因组多样性与亚洲人群的演化)

1997 国家自然科学三等奖(中国若干特有珍稀动物类群的细胞与分子进化研究)

 

省奖

2013 云南省自然科学特等奖(基因组多样性与亚洲人群的演化)

1996 云南省自然科学一等奖(猕猴属的分子进化研究)

2001 云南省自然科学一等奖(滇金丝猴生物学研究)

2005 云南省自然科学一等奖(线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究)

2010 云南省自然科学一等奖(真兽类若干类群的分子系统学研究)

2013 云南省自然科学一等奖(动物适应性进化的分子机制)

2020 云南省自然科学一等奖(家养动物起源与驯化)

 

个人奖

1994 全国青年科技标兵

1996 第三届中国青年科学家奖

2004 何梁何利基金科学与技术进步奖

2004 生命科学创新奖(全球华人生物科学家大会)

2004 中国青年五四奖章

2005 云南省科学技术突出贡献奖

2006 长江学者成就一等奖

2009 第二届谈家桢生命科学成就奖

  代表论著

代表论文(部分)

 

生物多样性格局、形成与演化

1.     Ryder OA, McLaren A, Brenner S, Zhang YP, Benirschke K. Ecology - DNA banks for endangered animal species. Science, 2000, 288:275-277.

2.     Murphy WJ, Eizirik E, Johnson WE, Zhang YP, Ryder OA, O'Brien SJ. Molecular phylogenetics and the origins of placental mammals. Nature, 2001, 409:614-618.

3.     Zhang JZ, Zhang YP, Rosenberg HF. Adaptive evolution of a duplicated pancreatic ribonuclease gene in a leaf-eating monkey. Nature Genetics, 2002, 30:411-415.

4.     Liu JX#, Gao TX*, Wu SF, Zhang YP*. Pleistocene isolation in the northwestern Pacific marginal seas and limited dispersal in a marine fish, Chelon haematocheilus (Temminck & Schlegel, 1845). Molecular Ecology, 2007, 16:275-288.

5.     Shen YY#, Liang L, Zhu ZH, Zhou WP, Irwin DM, Zhang YP*. Adaptive evolution of energy metabolism genes and the origin of flight in bats. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2010, 107:8666-8671.

家养动物起源与驯化

1.     Savolainen P, Zhang YP, Luo J, Lundeberg J, Leitner T. Genetic evidence for an East Asian origin of domestic dogs. Science, 2002, 298:1610-1613.

2.     Pang JF#, Kluetsch C#, Zou XJ#, Zhang AB#, Luo LY, Angleby H, Ardalan A, Ekstrom C, Skollermo A, Lundeberg J, Matsumura S, Leitner T, Zhang YP*, Savolainen P*. mtDNA data indicate a single origin for dogs south of Yangtze River, less than 16,300 years ago, from numerous wolves. Molecular Biology and Evolution, 2009, 26:2849-2864.

3.     Wang GD#, Zhai WW#, Yang HC, Fan RX, Cao X, Zhong L, Wang L, Liu F, Wu H, Cheng LG, Poyarkov AD, Poyarkov NA, Tang SS, Zhao WM, Gao Y, Lv XM, Irwin DM, Savolainen P, Wu CI*, Zhang YP*. The genomics of selection in dogs and the parallel evolution between dogs and humans. Nature Communications, 2013, 4: 1860

4.     Wang GD#, Zhai WW#, Yang HC#, Wang L#, Zhong L, Liu YH, Fan RX, Yin TT, Zhu CL, Poyarkov AD, Irwin DM, Hytonen MK, Lohi H, Wu CI, Savolainen P*, Zhang YP*. Out of southern East Asia: the natural history of domestic dogs across the world. Cell Research, 2016, 26:21-33.

5.     Liu YP#, Wu GS#, Yao YG, Miao YW, Luikart G, Baig M, Beja-Pereira A, Ding ZL, Palanichamy MG, Zhang YP*. Multiple maternal origins of chickens: out of the Asian jungles. Molecular Phylogenetics and Evolution, 2006, 38:12-19.

6.     Miao YW#, Peng MS#, Wu GS, Ouyang YN, Yang ZY, Yu N, Liang JP, Pianchou G, Beja-Pereira A, Mitra B, Palanichamy MG, Baig M, Chaudhuri TK, Shen YY, Kong QP, Murphy RW, Yao YG, Zhang YP*. Chicken domestication: an updated perspective based on mitochondrial genomes. Heredity, 2013, 110:277-282.

7.     Wang MS#, Thakur M#, Peng MS#, Jiang Y#, Frantz LAF#, Li M, Zhang JJ, Wang S, Peters J, Otecko NO, Suwannapoom C, Guo X, Zheng ZQ, Esmailizadeh A, Hirimuthugoda NY, Ashari H, Suladari S, Zein MSA, Kusza S, Sohrabi S, Kharrati-Koopaee H, Shen QK, Zeng L, Yang MM, Wu YJ, Yang XY, Lu XM, Jia XZ, Nie QH, Lamont SJ, Lasagna E, Ceccobelli S, Gunwardana HGTN, Senasige TM, Feng SH, Si JF, Zhang H, Jin JQ, Li ML, Liu YH, Chen HM, Ma C, Dai SS, Bhuiyan AFH, Khan MS, Silva GLLP, Le TT, Mwai OA, Ibrahim MNM, Supple M, Shapiro B, Hanotte O, Zhang GJ, Larson G, Han JL*, Wu DD*, Zhang YP*. 863 genomes reveal the origin and domestication of chicken. Cell Research, 2020, 38: 693-701.

8.     Li J#, Yang H, Li JR, Li HP, Ning T, Pan XR, Shi P*, Zhang YP*. Artificial selection of the melanocortin receptor 1 gene in Chinese domestic pigs during domestication. Heredity, 2010, 105:274-281.

9.     Zhou ZY#, Li AM#, Otecko NO, Liu YH, Irwin DM, Wang L, Adeola AC, Zhang JY, Xie HB, Zhang YP*. PigVar: a database of pig variations and positive selection signatures. Database-the Journal of Biological Databases and Curation, 2017, 1-10.

10. Xie HB#*, Wang LG#, Fan CY#, Zhang LC#, Adeola CA, Yin X, Zeng ZB*, Wang LX*, Zhang YP*. Genetic architecture underlying nascent speciation of Eurasian domestic pigs. Molecular Biology and Evolution, 2020, 38:3556-3566

11. Li JB#, Wang LG#, Yu DW#, Hao JF#, Zhang LC#, Adeola CA, Mao BY, Gao Y, Wu SF, Zhu CL,Zhang YQ, Ren JL, Mu CG, David M. Irwin, Wang LX*, Hai T*, Xie HB*, Zhang YP*. Single-cell RNA-sequencing Reveals Thoracolumbar Vertebra Heterogeneity and Rib-genesis in Pigs. Genomics Proteomics & Bioinformatics, 2021, 19:423-436.

人群历史演化

1.     Yao YG, Kong QP, Bandelt HJ, Kivisild T, Zhang YP*. Phylogeographic differentiation of mitochondrial DNA in Han Chinese. American Journal of Human Genetics, 2002, 70:635-651.

2.     Kong QP#*, Bandelt HJ, Sun C, Yao YG, Salas A, Achilli A, Wang CY, Zhong L, Zhu CL, Wu SF, Torroni A, Zhang YP*. Updating the East Asian mtDNA phylogeny: a prerequisite for the identification of pathogenic mutations. Human Molecular Genetics, 2006, 15:2076-2086. 

3.   Yang XY#, Allah Rakh#, Chen W, Hou JZ, Qi XB, Shen QK, Dai SS, Sulaiman X, Abdulloevich NT, Afanasevna ME, Ibrohimovich KB, Chen X, Yang WK, Adnan A, Zhao RH, Yao YG, Su B, Peng MS*, Zhang YP*.Tracing the genetic legacy of the Tibetan Empire in the Balti. Molecular Biology and Evolution, 2020,38:1529-1536. 

 

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科研进展报道(部分)

1. 家猪胸腰椎发育关键基因Hoxa10(http://www.kiz.cas.cn/xwzx/kydt/202111/t20211123_6269809.html

2. 家犬适应欧洲牛奶饮食的遗传机制(http://www.kiz.cas.cn/xwzx/kydt/202107/t20210729_6149747.html

3. 驯化下早期物种形成的基因组调控机制 (http://www.kiz.cas.cn/xwzx/kydt/202104/t20210425_5996915.html

4. 分子遗传学揭示吐蕃人群扩张历史(http://www.kiz.cas.cn/xwzx/kydt/202012/t20201209_5814026.html

5. 基因组研究揭示全球家鸡起源与驯化历史(http://www.kiz.cas.cn/xwzx/kydt/202006/t20200625_5611968.html

 

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  研究团队

研究人员

彭旻晟 研究员 (pengminsheng@mail.kiz.ac.cn)

谢海兵 副研究员 (xiehb@mail.kiz.ac.cn)

周中银 副研究员 (zhouzhongyin@mail.kiz.ac.cn)

柳延虎 副研究员 (zhouzhongyin@mail.kiz.ac.cn)

Adeniyi C. Adeola 助理研究员 (chadeola@mail.kiz.ac.cn)

李建波 特别研究助理 (lijianbo@mail.kiz.ac.cn)

李锦秀 特别研究助理 (lijinxiu@mail.kiz.ac.cn)

 

技术支撑人员

  正高级工程师 gaoy@mail.kiz.ac.cn

尹婷婷 高级工程师 yintingting@mail.kiz.ac.cn

朱春玲 实验师 zhucl@mail.kiz.ac.cn

邓家坤 工程师 dengjiakun@mail.kiz.ac.cn

谢国丽 工程师 xieguoli@mail.kiz.ac.cn

张树润 助理实验师 zhangshurun@mail.kiz.ac.cn

吴汝念 助理工程师 wurunian@mail.kiz.ac.cn

张云春 助理工程师 zhangyunchun@mail.kiz.ac.cn

  助理工程师 yangxiao@mail.kiz.ac.cn

  助理工程师 puzhao@mail.kiz.ac.cn

 

研究生

博士研究生(在读)

戴珊珊(2017

 晨(2017

 成(2018

许明敏(2018

张越东(2018

李应菊(2019

 轩(2019

伍胤桥(2019

周博闻(2019

 婕(2020

 行(2020

孙伟杰(2020

 蓉(2020

秦婉婷(2021

 贤(2021

石田赔(2021

 林(2021

 超(2021

童奕博(2022

肖玉焕(2022

硕士研究生(在读)

Lameck Odongo2019

母昌概(2019

王凤娟(2019

牛文静(2019

吴然燃(2020

丁梦婷(2020

曹学娜(2020

刘利生(2021

岑道机(2021

宋修成(2021

黄爱如(2022

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