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吴东东  研究员
灵长类进化遗传与发育学科组
职  务:
学  历: 博士
电  话: +86 871 68526518
传  真:
电子邮件: wudongdong@mail.kiz.ac.cn
通讯地址: 昆明市茨坝镇青松路21号西南生物多样性实验室 中国科学院昆明动物研究所    650223
其他主页: http://wulab.kiz.ac.cn/
  简  历

研究员,博士生导师。

2002/09-2006/07, 复旦大学, 生命科学院生物技术系, 理学学士

2006/09-2011/01, 中国科学院昆明动物研究所,遗传学专业,博士

2011/01-2016.1,中国科学院昆明动物研究所,副研究员

2015/12-,中国科学院昆明动物研究所,青年科学家小组, PI

2016.1-,中国科学院昆明动物研究所,研究员

  研究方向

1. 灵长类进化遗传与发育

利用灵长类动物资源,借助多组学测序技术,整合进化生物学、系统生物学、生物信息学等分析手段和思想,通过多学科交叉,解析灵长类复杂性状进化发育的遗传机制。

2. 家养动物环境适应的遗传机制

基于大规模组学数据,综合利用各种生物学方法,解析家养动物适应不同自然环境的遗传机制。 

  承担科研项目

1、国家自然科学基金优秀青年基金项目

2、国家自然科学基金面上项目,31671325、年轻新起源lincRNA基因在人类神经系统中的进化和功能研究、2017/01-2020/12

3、中国科学院战略性先导科技专项(B类)——青藏高原家养动物适应性状的解析

  专家类别
青年科学家小组
  社会任职
 
  获奖及荣誉

2012 年,中国科学院百篇优秀博士论文奖,个人奖。

2013 年,云南省自然科学奖特等奖(基因组多样性与亚洲人群的演化),排名第三。

2013 年,云南省自然科学奖一等奖(动物适应性进化的分子机制),排名第五。

2013 年,入选中国科学院青年创新促进会。

2014 年,中国科学院卢嘉锡青年人才奖,个人奖。

2015 年,国家自然科学奖二等奖(基因组多样性与亚洲人群的演化),排名第三。

  代表论著

#共同通讯作者

家养动物环境适应的遗传机制

1.      Shao Y, Tian HY, Zhang JJ, Kharrati-Koopaee H, Guo X, Zhuang XL, Li ML, Nanaie HA, Dehghani Tafti E, Shojaei B, Reza Namavar M, Sotoudeh N, Adeola Oluwakemi A, Li JL, Liang B#, Esmailizadeh A#, Wang S#, Wu DD #. Molecular Biology and Evolution. 2019 doi: 10.1093/molbev/msz208.

2.      Zeng L, Tu XL, Dai H, Han FM, Lu BS, Wang MS, Nanaei HA, Tajabadipour A, Mansouri M, Li XL, Ji LL, Irwin DM, Zhou H, Liu M, Zheng HK, Esmailizadeh A #, Wu DD #. Genome Biology 2019 20(1):79.

3.      Shi Y, Fan S, Wu M, Zuo Z, Li X, Jiang L, Shen Q, Xu P, Zeng L, Zhou Y, Huang Y, Yang Z, Zhou J, Gao J, Zhou H, Xu S, Ji H, Shi P, Wu DD#, Yang C#, Chen Y#. Nature Communications. 2019 10(1):4892.

4.      Wu DD#, Yang CP, Wang MS, Dong KZ, Yan DW, Hao ZQ, Fan SQ, Chu SZ, Shen QS, Jiang LP, et al: Convergent genomic signatures of high altitude adaptation among domestic mammals. National Science Review 2019.

5.      Wu DD#, Ding XD, Wang S, Wójcik JM, Zhang Y, Tokarska M, Li Y, Wang MS, Faruque O, Nielsen R#, Zhang Q#, Zhang YP#. Nature Ecology Evolution. 2018 2(7):1139-1145.

6.      Zeng L, Ming C, …, Wu DD# Zhang YP #. Molecular Biology and Evolution 22018 1:149–158. (cover)

7.      Zeng L, Ming C, …, Wu DD, # and Zhang YP #. Molecular Biology and Evolution 2017, 34(12):3148-3153.

8.      Li Y, Wang MS, Otecko N, Wang W, Shi P, Wu DD#, Zhang YP#. Cell Research 2017 27(2):302-305.

9.      Wang MS, Yang HC, Otecko N, Wu DD#, Zhang YP#. Nature Genetics 2016 48(9):972-973.

10.  Wang MS, Su LY, Li Y, Peng MS, Liu HQ, Zeng L, Irwin DM, Yao YG, Wu DD*, and Zhang YP *. Cell Research 2016 26(5):556-573

11.  Wang MS*, Li Y*, Peng MS*, Zhong L, Wang ZJ, Li QY, Tu XL, Dong Y, Zhu CL, Wang L, Yang MM, Wu SF, Miao YW, Liu JP, Irwin DM, Wang W, Wu DD#, Zhang YP#. Molecular Biology and Evolution 2015 32(7):1880-1889.

12.  Li Y, Wu DD#, Boyko AR, Wang GD, Wu SF, Irwin DM, Zhang YP#. Population variation revealed high-altitude adaptation of Tibetan mastiffs.  Molecular Biology and Evolution 2014 31(5):1200-1205. 

13.  Li Y, vonHoldt BM, Reynolds A, Boyko AR, Wayne RK, Wu DD#, Zhang YP#. Artificial selection on brain expressed genes during the domestication of dog. Molecular Biology and Evolution 2013 30(8):1867-76. 

 

灵长类进化遗传与发育方向

14.  Li ML, Wu SH, Zhang JJ, Tian HY, Shao Y, Wang ZB, Irwin DM, Li JL, Hu XT#, Wu DD#. 547 Transcriptomes from 44 Brain Areas Reveal Features of the Aging Brain in Non-Human Primates. Genome Biology. 2019.

15.  Ye LQ, Zhao H, Zhou HJ, Ren XD, Liu LL, Otecko NO, Wang Zb, Yang MM, Zeng L, Hu XT, Yao YG, Zhang YP#, Wu DD #. The RNA editome of Macaca mulatta and functional characterization of RNA editing in mitochondria. Science Bulletin 2017 62:820-830 (cover).

16.  Wu DD, Ye LQ, Li Y, Sun YB, Shao Y, Chen C, Zhu Z, Zhong L, Wang L, Irwin DM, Zhang YE, Zhang YP#. Integrative analyses of RNA-editing, alternative splicing and expression of young genes in human brain transcriptome by deep RNA-sequencing. Journal of Molecular Cell Biology 2015 7(4):314-325. (F1000)

17.  Jin W*, Wu DD*#, Zhang X, Irwin DM, Zhang YP#. Positive Selection on the Gene RNASEL: Correlation between Patterns of Evolution and Function. Molecular Biology and Evolution 2012 29(10):3161-8.

18.  Wu DD, Irwin DM, Zhang YP#. De novo origin of human protein coding genes. PLoS Genetics 2011 7(11):e1002379

19.Wu DD, Zhang YP#. Positive selection drives population differentiation in the skeletal genes in modern humans. Human Molecular Genetics. 2010 19(12):2341-6.

  研究团队

工作人员

曾琳  博士 副研究员

邵永  博士 助理研究员

张宝林  博士 助理研究员

王胜  博士后

杨敏敏  实验师

马夕尧  助理实验师

研究生

李明莉 2015级 硕博研究生

Ayoola Adeola Oluwakemi 2017级 博士研究生

田航宇 2018级博士研究生

张锦锦 2019级博士研究生

张佳进 2019级博士研究生

Said Ismael Nganga 2019级博士研究生

任小蝶 2017级 硕士研究生

庄晓琳 2018级 硕士研究生

陈勇璇 2019级 硕士研究生

李彦旭 2019级 硕士研究生

 

以往毕业学生

叶凌群  Houston Methodist Postdoc

王明山  UCSC Postdoc

王运梅  Skoltech Postdoc

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