专家人才     首页 > 研究队伍
孔庆鹏  研究员
人类进化与疾病基因学科组
职  务:
学  历: 理学博士
电  话: +86 871 65197967
传  真: +86 871 65197967
电子邮件: kongqp@mail.kiz.ac.cn
通讯地址: 云南省昆明市教场东路32号    650223
其他主页:
  简  历

  2009.7-至今    中国科学院昆明动物所 分子人类学学科组 PI 

  2009.6-至今    中国科学院昆明动物研究所 遗传资源与进化国家重点实验室,博士生导师 

  2008.9-至今    中国科学院昆明动物研究所 遗传资源与进化国家重点实验室,研究员 

  2005.122008.8  中国科学院昆明动物研究所 分子进化与基因组多样性实验室,副研究员 

  2005.62005.11  中国科学院昆明动物研究所 分子进化与基因组多样性实验室,助理研究员 

  1999.92005.6    中国科学院昆明动物研究所,理学博士 

  1995.91999.7    兰州大学生命科学学院,理学学士 

  目前已在本领域著名国际SCI期刊《American Journal of Human Genetics》、《PNAS》、《Human Molecular Genetics》、《Molecular Biology and Evolution》、《BMC Biology》、《International Journal of Cancer》、《Human Genetics》、《American Journal of Physical Anthropology》及《PLoS ONE》等上接受发表论文及评论60余篇,其中影响因子9以上的论文有14篇(7篇为通讯或第一作者)。在国际人类线粒体DNA研究领域获得了广泛影响,迄今论文被SCI刊物累计引用超过2160次,其中第一作者论文最高引用189次,通讯作者论文最高引用超过200次。曾应邀作为审稿人为《PLoS Biology》、《Human Mutation》、《Electrophoresis》、《BMC Evolutionary Biology》、《FEBS Letters》、《Proceedings of the Royal Society B》、《BMC Genetics》、《American Journal of Physical Anthropology》、《Neurodegenerative Diseases》、《Journal of Genetics and Genomics》、《Molecular Vision》、《Human Biology》、《中国科学》及《自然科学进展》等十余种重要SCI期刊审阅稿件。 

  研究方向

  研究方向为分子人类学,研究兴趣为:基于遗传标记研究人群的源流历史及环境适应机制,以此为框架探讨人类重大疾病或重要性状产生的遗传学机理。目前本实验室已经开展以下两个方面的研究工作: 

  1、东亚人群源流历史研究: 

  线粒体DNA(mitochondrial DNA, mtDNA)由于其具有的一些遗传学特性如缺乏重组、母系遗传、高突变率等,因而被广泛应用于人类起源及演化研究。随着对世界范围内人群母系遗传组成认识的逐渐清晰以及随之而来的对人群源流历史了解的逐步加深,目前的研究重心逐渐转移到重建一些近期的重要人群历史事件或重大考古学现象,而达到该目标则需要更丰富的遗传信息及更为精细的分析。鉴于此,本研究组目前主要基于mtDNA全基因组信息,充分结合我们前期构建的精细的东亚人群mtDNA系统发育关系树,针对性研究东亚及周边地区人群的族源历史及重大考古学事件在现代人群中的遗传印记等。 

  2、长寿人群的遗传学基础研究: 

长寿是极度衰老的表现,而前期的研究结果表明,长寿具有家族聚集性的现象,且其遗传力大约在25%左右,但长寿的遗传机理究竟为何至今仍不清楚。与此同时,通过对长寿遗传相关因素的研究,不但有助于深入理解可能影响(延缓)衰老进程的遗传因子,而且还可能对了解衰老相关疾病的遗传机制提供新的线索。本研究组主要基于群体遗传学思路,采用候选基因及基因组学等技术手段,深入研究中国长寿人群可能存在的相关遗传因素。

  承担科研项目

执行年限 

项目来源 

项目名称 

项目号 

项目资助金额 

2014.01-2016.12 

国家自然科学基金委优秀青年项目 

人类进化遗传 

31322029 

100 

2013.01-2016.12 

国家自然科学基金委面上项目 

食管癌呼吸链编码核基因的体细胞突变模式及其自然选择信号研究 

81272309 

70 

2013.01-2015.12 

中国科学院科技创新交叉与合作团队 

老年痴呆症的分子机理与演化机制 

  

100 

2012.01-2015.12 

科技部973计划 

高原低氧环境的快速习服与长期适应机制研究 

2012CB518200 

100 

2011.10-2014.9 

云南省应用基础研究计划 

基于线粒体基因组研究云南长寿人群的遗传基础 

2011FA024 

40 

  专家类别
研究员
  社会任职
 
  获奖及荣誉

  2005年:第四届云南省青年科技奖 

  2005年:云南省优秀科学论文特等奖(第一获奖人) 

  2005年:云南省科学技术奖一等奖(项目名称:线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究;完成人:张亚平,姚永刚,孔庆鹏,丁远春,孙昌) 

  2006年:云南省人民政府特殊津贴 

  2006年:国家自然科学奖二等奖(项目名称:线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究;完成人:张亚平,姚永刚,孔庆鹏,丁远春,孙昌) 

  2007年:全国百篇优秀博士学位论文奖 

  2008年:中国科学院青年人才奖 

  2011年:中国科学院西部学者突出贡献奖 

  2012年:云南省中青年学术和技术带头人 

  2013年:首届吴旻人类与医学遗传创新奖 

  2013年:科技部中青年科技创新领军人才计划 

    2014年:云南省自然科学奖特等奖(项目名称:基因组多样性与亚洲人群的演化;完成人:张亚平,孔庆鹏,吴东东,彭旻晟,孙昌)

  代表论著

  * 通讯作者) 

  [1]He Y-H, Lu X, Cai W-W*, Yang L-Q, Xu L-Y, Sun H-P, Kong Q-P* (2014) Mitochondrial DNA content contributes to healthy aging in Chinese: a study from nonagenarians and centenarians. Neurobiology of Aging 35(2014):1779.e1-1779.e4 (Impact Factor:6.166) 

  [2]Liu Y-W, He Y-H, Zhang Y-X, Cai W-W*, Yang L-Q, Xu L-Y, Kong Q-P* (2014) Absence of A673T variant in APP gene indicates an alternative protective mechanism contributing to longevity in Chinese individuals. Neurobiology of Aging 35(2014): 935.e11-935.e12. (Impact Factor: 6.166) 

  [3]Cheng Y-T, Liu J, Yang L-Q, Sun C, Kong Q-P* (2013) Mitochondrial DNA content contributes to climate adaptation using Chinese populations as a Model. PLoS ONE 8(11):e79536 (Impact Factor: 3.73) 

  [4]Liu J, Wang L-D, Sun Y-B, Li E-M, Xu L-Y, Zhang Y-P, Yao Y-G, Kong Q-P* (2012) Deciphering the signature of selective constraints on cancerous mitochondrial genome. Molecular Biology and Evolution 29(4):1255–1261 (Impact Factor:10.353) 

  [5]Wang H-W, Li Y-C, Sun F, Zhao M, Mitra B, Chaudhuri TK, Regmi P, Wu S-F, Kong Q-P*, Zhang Y-P* (2012) Revisiting the role of the Himalayas in peopling Nepal: insights from mitochondrial DNA genomes. Journal of Human Genetics 57:228234 (Impact Factor: 2.365) 

  [6]Elson JL, Sweeney MG, Procaccio V, Yarham JW, Salas A, Kong Q-P, van der Westhuizen FH, Pitceathly RD, Thorburn DR, Lott MT, Wallace DC, Taylor RW, McFarland R (2012) Towards a mtDNA locus-specific mutation database using the 

  LOVD platform. Human Mutation 33(9):13521358  (Impact Factor: 5.213) 

  [7]Wang C-Y, Li H, Hao X-D, Liu J, Wang J-X, Kong Q-P*, Zhang Y-P* (2011) Uncovering the profile of somatic mtDNA mutations in Chinese colorectal cancer patients. PLoS ONE 6(6):e21613. doi:10.1371/journal.pone.0021613 (Impact Factor: 3.73) 

  [8]Peng M-S, Palanichamy Mg, Yao Y-G, Mitra B, Cheng Y-T, Zhao M, Liu J, Wang H-W, Pan H, Wang W-Z, Zhang A-M, Zhang W, Wang D, Zou Y, Yang Y, Chaudhuri TK, Kong Q-P*, and Zhang Y-P* (2011) Inland post-Glacial dispersals in East Asia revealed by mitochondrial haplogroup M9a’b. BMC Biology 9:2 (Impact Factor: 6.531) 

  [9]Wang H-W, Mitra B, Chaudhuri TK, Palanichamy Mg, Kong Q-P*, Zhang Y-P* (2011) Mitochondrial DNA evidence supports northeast Indian origin of the aboriginal Andamanese in the Late Paleolithic. Journal of Genetics & Genomics 38:117–122 (Impact Factor: 2.076) 

  [10]Kong Q-P*, Sun C, Wang H-W, Zhao M, Wang W-Z, Zhong L, Hao X-D, Pan H, Wang S-Y, Cheng Y-T, Zhu C-L, Wu S-F, Liu L-N, Jin J-Q, Yao Y-G, Zhang Y-P* (2011) Large-scale mtDNA screening reveals a surprising matrilineal complexity in East Asia and its implications to the peopling of the region. Molecular Biology and Evolution 28:513522 (Impact Factor: 10.353) 

  [11]Liu C, Wang S-Y, Zhao M, Xu Z-Y, Hu Y-H, Chen F, Zhang R-Z, Gao G-F, Yu Y-S, Kong Q-P (2011) Mitochondrial DNA polymorphisms in Gelao ethnic group residing in Southwest China. Forensic Science International-Genetics 5: e4e10 (Impact Factor : 3.861) 

  [12]Peng M-S, Ho Q-H, Pham D-K, Vu T-A, Wang H-W, Yao Y-G, Kong Q-P*, Zhang Y-P* (2010) Tracing the Austronesian footprint in mainland Southeast Asia: a perspective from mitochondrial DNA. Molecular Biology and Evolution 27: 24172430 (Impact Factor:10.353) 

  [13]Wang W-Z, Wang C-Y, Cheng Y-T, Xu A-L, Zhu C-L, Wu S-F, Kong Q-P*, Zhang Y-P* (2010) Tracing the origins of Hakka and Chaoshanese by mitochondrial DNA analysis. American Journal of Physical Anthropology 141:124130  (Impact Factor: 2.481) 

  [14]Zhao M, Kong Q-P*, Wang H-W, Yao Y-G, Xie X-D, Wang W-Z, Jiayang, Duan J-G, Cai M-C, Zhao S-N, Cidanpingcuo, Tu Y-Q, Wu S-F, Yao Y-G, Bandelt H-J, and Zhang Y-P*. (2009) Mitochondrial genome evidence reveals successful Late Paleolithic settlement on the Tibetan Plateau. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106:21230–21235 (Impact Factor: 9.737 ) 

  [15] Kong Q-P, Salas A, Sun C, Fuku N, Tanaka M, Zhong L, Wang C-Y, Yao Y-G, Bandelt H-J (2008) Distilling artificial recombinants from large sets of complete mtDNA genomes. PLoS ONE 3(8): e3016. (Impact Factor =4.351) 

  [16] Wang C-Y, Wang H-W, Yao Y-G, Kong Q-P*, Zhang Y-P* (2007) Somatic mutations of mitochondrial genome in early stage breast cancer. International Journal of Cancer 121:1253–1256 (Impact Factor =4.555) 

  [17] Kong Q-P*, Bandelt H-J, Sun C, Yao Y-G, Salas A, Achilli A, Wang C-Y, Zhong L, Zhu C-L, Wu S-F, Torroni A, Zhang Y-P* (2006) Updating the East Asian mtDNA phylogeny: a prerequisite for the identification of pathogenic mutations. Human Molecular Genetics 15:2076–2086 (Impact Factor =8.099) 

  [18] Sun C, Kong Q-P(co-first author), Palanichamy Mg, Agrawal S, Yao Y-G, Zhu C-L, Bandelt H-J, Zhang Y-P (2006) The dazzling array of basal branches in the mtDNA macrohaplogroup M from India as inferred from complete genomes. Molecular Biology and Evolution 23: 683–690 (Impact Factor =6.726) 

  [19] Kong Q-P, Yao Y-G, Sun C, Bandelt H-J, Zhu C-L, Zhang Y-P (2003) Phylogeny of East Asian mitochondrial DNA lineages inferred from complete sequences. American Journal of Human Genetics 73:671–676 (Impact Factor=11.602) 

  [20] Yao Y-G, Kong Q-P(co-first author), Wang C-Y, Zhu C-L, Zhang Y-P (2004) Different matrilineal contributions to genetic structure of ethnic groups in the Silk Road region in China. Molecular Biology and Evolution 21:2265–2280 (Impact Factor =6.355) 

  [21] Kong Q-P, Yao Y-G, Liu M, Shen S-P, Chen C, Zhu C-L, Palanichamy Mg, Zhang Y-P (2003) Mitochondrial DNA sequence polymorphisms of five ethnic populations from northern China. Human Genetics 113:391–405 (Impact Factor =4.022) 

  [22]Kong Q-P, Yao Y-G, Sun C, Bandelt H-J, Zhu C-L, Zhang Y-P (2003) Phylogeny of East Asian mitochondrial DNA lineages inferred from complete sequences. American Journal of Human Genetics 73:671–676 (Impact Factor: 11.202 ) 

  研究团队

 

Copyright © 2018-2019 中国科学院昆明动物研究所 .All Rights Reserved
地址:云南省昆明市五华区教场东路32号  邮编:650223
电子邮件:zhanggq@mail.kiz.ac.cn  滇ICP备05000723号